Christoph Steinbeck教授讨论现象-一个新的在线门户，允许研究人员和临床医生执行大规模代谢组学数据分析。

 

EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL- ebi)和其他13个合作伙伴开展了一项国际合作，推出了“现象”软件，使得大规模代谢组学分析变得更加容易。天富代理分红

 

代谢组学是研究存在于细胞、生物液、组织和器官中的小分子。这些分子(代谢物)及其浓度反映了潜在的生化活性，从而影响细胞或组织的健康。代谢组学可能成为精准医疗的必要工具，帮助病人诊断和可能的治疗选择。

 

现象级允许研究人员进行如此复杂的代谢组学分析。例如，研究人员可以在病人的数据中搜索模式，并利用这些发现来改进疾病的检测和帮助优化治疗。天富代理分红

 

在接受SciTech采访时，现象网站的科学协调员Christoph Steinbeck教授解释了为什么在线门户很重要，它可以实现什么，以及在开发和推出过程中遇到的一些挑战。

 

为什么像现象这样的工具对研究界很重要?它对未来精准医疗的最大好处是什么?

 

对于像观察团这样的基础设施来说，最重要的目标是降低研究人员(包括在计算方面的临床研究人员)的准入门槛，以便他们能够更容易地访问计算代谢组学工作流。在我们创建现象组之前，这个领域本质上是由各个实验室组成的，这些实验室会采用各种现有的代谢组学工具，并试图将它们整合到对它们有效的工作流程中。我们在这里引入了一个巨大的变化。

 

当然,关于基础设施,这是欧盟委员会(European Commission)的目标之一——通过电话基础设施提供最佳实践工具使用的各种各样的人,标准操作程序和协议可以实现为可重用的工作流程,和非凡的肯定关系。事实上,通过这个项目,我们提供一个基础设施即服务(IaaS)计算人员在诊所,如果人们使用这个基础设施和反馈标准操作程序和协议的基础设施,然后他们成为别人立即在地里干活。

 

该基础设施的主要目的是有利于临床研究领域，但我们也可以为任何其他复杂类型的研究提供服务，这些研究需要对数据在处理过程中实际发生的情况进行严密的审计跟踪。

 

说到精准医疗的好处，首先，这又回到了降低临床科学家使用代谢组学数据的门槛上。代谢组学极有可能使药物从单一的生物标记物转变为更复杂的模式，利用整个代谢组物作为生物标记物。但是，要真正理解对病人的所有不同影响是如何改变代谢组的——有很多这样的影响，包括锻炼、营养、药物等等——是一个巨大的挑战。这本质上是一个大数据问题，许多患者的数据和元数据需要与他们的代谢组测量和其中的变化联系起来。通过提供关于如何修改和使用这些数据的最佳实践，remarkable可以提供帮助。天富代理主管

 

有了像非凡这样的基础设施，我们也在向所谓的“研究对象”迈进，它是临床数据的结合，人们正在研究的协议、参数和最佳实践，所有这些都在可执行的工作流程中实现。这个研究对象可以让研究人员复制，例如，在科学文献中，只要点击一个按钮，就可以复制完整的出版物，因为这里不仅有数据，还有可执行的工作流程。

 

例如，我们在瑞典乌普萨拉医院的同事，最近使用代谢组学数据作为生物标记，在疾病进展的早期诊断继发性进行性多发性硬化症，这是一个令人印象深刻的证明，这是一个有用的基础设施。

 

创建在线门户的最大挑战是什么?对EMBL-EBI来说，与外部合作伙伴合作有多重要?

 

我们在可用性和技术方面都遇到了挑战。我们希望构建一个基于云的基础设施，以确保现象级的可移植性尽可能好。但构建云服务意味着你总是瞄准一个快速移动的目标;如果你想在最新的技术上开发产品，这当然是我们想做的，那么你就必须跟上一些非常大的行业参与者——比如亚马逊、